Selv om den nøyaktige opprinnelsen til Boergeita ikke er helt klar, er den sannsynligvis et resultat av krysning mellom afrikanske geiter, indiske geiter og angorageiter, samt noe innflytelse fra europeiske melkegeiter. Den nåværende Boergeita dukket opp i begynnelsen av 1900, da østlige Capbønder begynte å velge ut dyr etter kjøttfylde. Navnet kommer fra det hollandske ordet for bonde, Boer. Disse bøndene var hovedsakelig hollandske kolonister. South Africa Boer Goat Breeders Association utformet en rasestandard for Boergeita i 1959.

De første Boergeitene kom til Norge fra Danmark i 2003. Etter det er det importert dyr til noen få besetninger i Norge. I 2011 ble den første sæden importerte til Norge gjennom et samarbeid mellom Norsk sau og geit (NSG) og Norboer. Dette letter framtidig avlsarbeid for rasen.